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病院の腸内フローラ検査をご紹介|費用や方法について解説

菌と健康

2026.06.05

腸内フローラ検査について、病院で受ける場合の方法や流れ、費用の目安、メリット・注意点を解説します。

あわせて、自宅でできる検査キットとの違いや、それぞれに向いている人についても整理しています。

病院での腸内フローラ検査の受け方や選び方を知りたい方は、ぜひ参考にしてください。


腸内フローラ検査は病院で受けられる?


腸内フローラ検査は、一部の病院やクリニックなどの医療機関で受けられます。

内科や消化器内科などのクリニックをはじめ、健康診断センターや人間ドックのオプション検査として導入されているケースもあります。

また、同じ腸内フローラ検査でもさまざまな検査サービスがあり、料金や検査の内容、医療機関での対応などが異なります。

病院での検査を検討する際は、目的に合った内容かどうかを確認して選ぶことが大切です。

医療機関向けの検査サービスのひとつにSYMGRAM(シングラム)があります。
SYMGRAMは30以上の全身の病気のリスクを把握できるほか、腸内フローラの構成をふまえた推奨食品の情報などを含む検査・分析結果レポートについて、医師から説明・カウンセリングを受けることができます。
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腸内フローラ検査とは?


腸内フローラ検査とは、便中に含まれる腸内細菌の種類やバランス(割合)を分析して、腸内環境の状態を可視化する検査です。

検査結果をもとに、腸内環境の特徴を把握し、食生活や生活習慣の見直しに活かすことができます。

腸内フローラ検査について詳しくはこちら
腸内フローラ検査が意味ないといわれる理由について詳しくはこちら

そもそも腸内フローラとは?


腸内フローラとは、腸の中に存在する1,000種類以上、100兆個以上といわれる細菌の集まりを指します。

細菌は種類ごとにまとまって生息しており、その様子がお花畑のように見えることから「フローラ(flora)」と呼ばれています。

なお、医学的には「腸内細菌叢(ちょうないさいきんそう)」という名称が用いられます。

腸内細菌は、一般的には以下3種類に分類されるといわれています。
● 善玉菌
● 悪玉菌
● 日和見菌

それぞれのバランスは食生活や生活習慣などの影響によって変化します。

また、腸内細菌は、体の中でさまざまな働きをしていることも知られています。

たとえば、食べ物を分解する過程で短鎖脂肪酸と呼ばれる成分を生み出すなど、腸内環境だけでなく全身にも大きな影響を及ぼすことがわかっています。

善玉菌と悪玉菌について詳しくはこちら
短鎖脂肪酸の代表格「酪酸」について詳しくはこちら

腸内フローラ検査を病院で受けるメリット


病院やクリニックなどの医療機関で腸内フローラ検査を受ける主なメリットは、医師による説明や生活習慣に関するアドバイスを受けられる点です。

医療機関によっては、検査後に医師の問診や結果説明が行われる場合があり、内容を理解しながら検査結果を活用しやすくなります。

また、検査結果に基づいた食事や生活習慣に関するアドバイスを受けられることもあります。

ただし、こうした対応の内容は医療機関によって異なるため、事前に確認しておくとよいでしょう。


腸内フローラ検査を病院で受ける注意点


腸内フローラ検査を医療機関(病院・クリニック)で受ける際は、以下の点に注意が必要です。

● 対応している医療機関が限られている
● 受診や予約が必要で手間がかかる
● 自由診療のため費用が高くなる場合がある

腸内フローラ検査は、すべての医療機関で受けられるわけではありません。

地域によっては近くに受けられる医療機関がない場合もあるため、事前に確認しておくと安心です。

また、医療機関で検査を受ける場合は、予約や受診が必要となり、手間がかかる場合があります。

加えて、自由診療のため、診察料などが別途かかり、費用が高くなる場合があります。

腸内フローラ検査を病院で受ける流れ


病院やクリニックなどの医療機関によって異なりますが、一般的な流れは以下の通りです。

①医療機関で検査を申し込む
検査を実施している医療機関に予約・申し込みし、検査キットを受け取ります。
医療機関によっては、採便方法の説明や体調・生活習慣について簡単なヒアリングが行われる場合もあります。

②自宅で採便する
自宅で採便し、専用の容器に入れて検査会社へ送付します。採取した検体は返信用封筒に入れ、ポストに投函するのが一般的です。採取方法や保存状態によって結果に影響するため、説明書に従って正しく行いましょう。

③検査結果を確認する
数週間ほどで検査結果が出て、Webや紙のレポートで確認できます。
医療機関によっては、結果について医師や管理栄養士から説明やアドバイスを受けられる場合もあります。

病院の腸内フローラ検査の費用


病院やクリニックなどの医療機関での腸内フローラ検査は、自由診療(保険適用外)となり、費用は2万円〜6万円程度が目安です。

ただし、医療機関で受ける場合は、検査費用に加えて診察料や説明料などが別途かかる場合があります。

費用は検査内容やサポートの範囲によって異なります。

検査を選ぶ際は、価格だけでなく、検査でわかる内容や結果の活用方法もあわせて確認することが大切です。

医療機関向けの検査サービスのひとつにSYMGRAM(シングラム)があります。
SYMGRAMは30以上の全身の病気のリスクを把握できるほか、腸内フローラの構成をふまえた推奨食品の情報などを含む検査・分析結果レポートが提供されます。
医療機関によっては、医師から説明やカウンセリングを受けられる場合もあります。
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病院が難しい場合は自宅でできる腸内フローラ検査サービス・キットも


病院やクリニックなどの医療機関での受診が難しい場合は、自宅でできる個人向け腸内フローラ検査サービスを利用する方法もあります。

「医療機関を受診する時間がない」
「近くに腸内フローラ検査を実施している医療機関がない」…などの場合でも、自宅で手軽に腸内環境を調べることができます。

ただし、検査サービスによって検出できる菌の種類やわかる内容に違いがあります。

健腸ナビ」は、30以上の全身の病気のリスクを把握できるほか、検査結果に基づいて腸内フローラの構成にあわせた食品の提案も行われます。
自身の腸内環境に合わせて、より効果的な生活改善に取り組みやすい点が特長です。
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病院の腸内フローラ検査と自宅用腸内フローラ検査の違い


病院の腸内フローラ検査でも自宅用検査(個人向け)でも、検査方法は同じです。

自宅で便を採取し、ポストに投函して検査会社へ送付します。

一方で、費用や申し込み方法などに、以下のような違いがあります。

【腸内フローラ検査比較表】

比較項目自宅での検査(個人向け)病院・クリニックでの検査
費用の目安2万〜4万円程度2万〜6万円程度
(別途診察料がかかる場合あり)
申し込み方法Webサイトなどから検査キット購入医療機関で申し込み
手軽さ予約や受診不要予約や受診、来院が必要な場合がある
検査結果の受け取り方Webや書面で結果を確認する医療機関に書面で結果が届き、医師などから説明を受けられる場合がある。Webで結果を確認できる場合もある


腸内フローラ検査がおすすめな人は?


腸内フローラ検査は、以下のような人におすすめです。

● 腸内環境を客観的に知りたい人
● 腸活をより具体的に行いたい人
● 便秘や下痢など腸の不調について情報を整理したい人
● 健康管理の一環として腸内環境をチェックしたい人 …など

さらに、病院・クリニックでの検査と自宅での検査では、向いている人が異なります。

【病院・クリニックなど医療機関での検査が向いている人】
● 医師から説明やアドバイスを受けながら結果を理解したい
● 体調面の不安も含めて相談したい …など

【自宅での検査が向いている人】
● 忙しく、医療機関を受診する時間がない
● まずは手軽に腸内環境を知りたい …など

このように、自分の目的や状況に合わせて検査方法を選ぶことが大切です。

医療機関向けの検査サービスのひとつにSYMGRAM(シングラム)があります。
SYMGRAMは30以上の全身の病気のリスクを把握できるほか、腸内フローラの構成をふまえた推奨食品の情報などを含む検査・分析結果レポートが提供されます。
医療機関によっては、医師から説明やカウンセリングを受けられる場合もあります。
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自宅でできる検査キット「健腸ナビ」は医療機関で導入されている「SYMGRAM(シングラム)」と同じ精度の検査を、ご自宅でいつでも簡単に受けることができます。
健腸ナビ」では、30以上の全身の病気のリスクを把握できるほか、腸内環境の状態や生活改善へ向けてのおすすめ食品のアドバイスも受けることができます。
腸内環境から体調を見直したい方は、以下から詳細をご確認ください。
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腸内フローラ検査は病院で受けられるが目的に応じて選ぶことが大切

腸内フローラ検査は、医療機関で受ける方法と、自宅で受ける方法のいずれでも実施できます。

医師から説明やアドバイスを受けながら検査結果を理解したい場合は、医療機関での検査が向いています。

一方で、まずは手軽に腸内環境を知りたい場合は、自宅でできる検査を選ぶのもよいでしょう。

健腸ナビ」は、自宅で便を採取して送るだけで利用できる、腸内細菌叢の検査・分析サービスです。
医療機関で導入されている「SYMGRAM(シングラム)」と同じ精度の検査を、ご自宅でいつでも簡単に受けることができます。

【30以上の病気のリスクを可視化】
日本人約27,000人の腸内細菌叢データをもとに、腸内環境の傾向を分析し、大腸がんや認知症などの病気リスクを可視化。
特許取得済みの解析手法により、詳細なレポートで腸内環境の状態を把握できます。

【性差を考慮した精密な分析】
腸内細菌叢は男女で異なる特徴があり、病気と関連する腸内細菌の傾向にも違いがあります。
健腸ナビでは、性差をふまえて男女別に分析が行われており、より個々の状態に即した形で腸内環境を把握できます。

【自分に合ったおすすめの食品情報】
分析結果から導き出された、自身の腸内フローラの構成をふまえたおすすめ食品をご提案。
日々の食事選びの指針として、無理のない生活習慣の改善をサポートします。

腸内環境を知ることは、日々の体調管理や将来の健康を考えるきっかけにもつながります。

まずは現在のコンディションを把握し、無理のない範囲で生活改善に取り入れてみるのもよいでしょう。
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